数字PCR是通过基于单分子PCR方法来采用计数的方法对DNA进行定量，是一种绝对定量的工具。主要采用微流控的方法，将稀释后的DNA溶液分散至微反应器中，每个反应器的DNA模板数≤1个。这样经过PCR循环之后，有一个DNA模板的反应器就会亮，没有DNA模板的反应器就是暗的。根据相对比例和反应器的体积，就可以推算出原始溶液的DNA浓度。