RNA是染色质的组成部分,有助于染色质结构的组织化。染色质关联RNA在进化上高度保守,转录来自基因内和基因间区域。这些染色质关联RNA占染色质关联总核酸量的2%~5%,其大小与相应染色质区域的DNA相似。CAR功能特征的研究揭示,它们通过调节染色质结构来调节基因的表达。